Svojevremeno je Jovan Krneta kao talentovani defanzivac napravio neočekivan potez i potpisao za Crvenu zvezdu, nakon što je završio staž u mlađim kategorijama večitog rivala Partizana i igrao u njihovoj filijali Teleoptiku.
On je potom igrao i za Zvezdinu tadašnju filijalu Sopot, a nastupao je i za crveno-bele, ali nije uspeo da izgradi značajnu karijeru.
Nastupao je nakon toga za Radnički iz Kragujevca, Černomorec, Levadijakos, Inđiju, Rudar, Smederevo i azerbejdžansku Ziru, u koju bi sada mogao da se vrati.
On je od letos u Hajduku iz Kule, nekada superligašu a sada članu Srpske lige Vojvodine. Međutim, prema navodima azerbejdžanskog portala “Azerisport”, narednih dana bi trebalo da bude ozvaničen povratak u Ziru, a ugovor bi bio potpisan do kraja aktuelne sezone.